RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF536O15090 1300 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3CDO00329 1044 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 CFAP157Q5JU67 520 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PHF12Q96QT6 1004 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 STKLD1Q8NE28 680 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 TLK2Q86UE8 772 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SMYD1Q8NB12 490 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PPFIBP2Q8ND30 876 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 TLE6Q9H808 572 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA7Q9P0W8 599 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 LY6KQ17RY6 165 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 AAASQ9NRG9 546 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF711Q9Y462 761 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT4O43236 478 aa10.62□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 OPHN1O60890 802 aa10.62□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 USP1O94782 785 aa10.62□□□□□ -0.71
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