RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 RRAGCQ9HB90 399 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 RAB20Q9NX57 234 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 EURLQ9NYK6 297 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 LRRC42Q9Y546 428 aa9.93□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CYP26A1O43174 497 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ATP2C2O75185 946 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ZWINTO95229 277 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CFBP00751 764 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 IL1BP01584 269 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 FGFR3P22607 806 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 GCLMP48507 274 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 RARRES1P49788 294 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ITGA8P53708 1063 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PSMC5P62195 406 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NFIAQ12857 509 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 COG2Q14746 738 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MORF4L2Q15014 288 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 EFHC2Q5JST6 749 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CCDC25Q86WR0 208 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PALB2Q86YC2 1186 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 OGFOD1Q8N543 542 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 HELQQ8TDG4 1101 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 AGAP11Q8TF27 550 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MAML1Q92585 1016 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 APBB2Q92870 758 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TLE6Q9H808 572 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.92□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SMIM23A6NLE4 172 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ALOX15BO15296 676 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TP73O15350 636 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CLDN3O15551 220 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 RAD21O60216 631 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 GRIN3BO60391 1043 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TJP3O95049 919 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ASMTLO95671 621 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TAC1P20366 129 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CALB2P22676 271 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PHBP35232 272 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MAGEA4P43358 317 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SLCO1A2P46721 670 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 IFNAR2P48551 515 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MARCKSL1P49006 195 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 AP3M2P53677 418 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CLDN10P78369 228 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MYO1EQ12965 1108 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 BLMHQ13867 455 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NAA25Q14CX7 972 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 E2F5Q15329 346 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TLR1Q15399 786 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PDK4Q16654 411 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PTPROQ16827 1216 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 LONRF1Q17RB8 773 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CCDC142Q17RM4 750 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 WDR78Q5VTH9 848 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 FYB2Q5VWT5 728 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 TRABD2AQ86V40 505 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 MASTLQ96GX5 879 aa9.91□□□□□ -0.82
HULC-201ENST00000503668 NGLY1Q96IV0 654 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms