RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MOB2Q70IA6 237 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CYFIP1Q7L576 1253 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SYCP3Q8IZU3 236 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CEP112Q8N8E3 955 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 TRIM58Q8NG06 486 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FBXO27Q8NI29 283 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MMP19Q99542 508 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GPR20Q99678 358 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FAM83CQ9BQN1 747 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CBWD1Q9BRT8 395 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GPR88Q9GZN0 384 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KATNBL1Q9H079 304 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 IKZF4Q9H2S9 585 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KMT5AQ9NQR1 393 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 NRBP2Q9NSY0 501 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GCNT4Q9P109 453 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 APEX2Q9UBZ4 518 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 TELO2Q9Y4R8 837 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FHOD1Q9Y613 1164 aa6□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 DENND3A2RUS2 1198 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ANKRD63C9JTQ0 380 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 F8VZ95 297 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 EXTL3O43909 919 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 AKR1B10O60218 316 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GREM1O60565 184 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ARIH2O95376 493 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GGPS1O95749 300 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 TUBBP07437 444 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ADRB2P07550 413 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 NFICP08651 508 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC172P0C7W6 258 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ACTN1P12814 892 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GLRA2P23416 452 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SOX5P35711 763 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 STAT1P42224 750 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MAGEA1P43355 309 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CYP2J2P51589 502 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GPC3P51654 580 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 STAT5BP51692 787 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 MYL7Q01449 175 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ID3Q02535 119 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ARID5AQ03989 594 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 POU5F1BQ06416 359 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 PPP3CAQ08209 521 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KLHL30Q0D2K2 578 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GRM1Q13255 1194 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KIF22Q14807 665 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 NAB2Q15742 525 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CBWD6Q4V339 395 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC122Q5T0U0 273 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 IQCEQ6IPM2 695 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ZPBP2Q6X784 338 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 USP37Q86T82 979 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KIAA1328Q86T90 577 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 KSR1Q8IVT5 923 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 ATP8B4Q8TF62 1192 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SCFD2Q8WU76 684 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 RABGGTAQ92696 567 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 IFT74Q96LB3 600 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 FAM81BQ96LP2 452 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 CRACR2AQ9BSW2 395 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.99□□□□□ -1.45
ATG4A-208ENST00000489247 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms