RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484886.1

SNX17-206, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 2

Gene SNX17, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-206ENST00000484886 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.51■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 CCNE1P24864 410 aa20.5■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.5■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 SYT15Q9BQS2 421 aa20.49■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 FGF13Q92913 245 aa20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.48■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.48■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.48■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 ZNF197O14709 1029 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 STX10O60499 249 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 BMP6P22004 513 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 PPP3CAQ08209 521 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 ITIH5Q86UX2 942 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 EDAQ92838 391 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 MUC3AQ02505 3323 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNX17-206ENST00000484886 ATP2C2O75185 946 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 TACC1O75410 805 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 CEBPBP17676 345 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 RAP1GAPP47736 663 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 STX17P56962 302 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX17-206ENST00000484886 ENPEPQ07075 957 aa20.46■□□□□ 0.87
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