RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 OBSL1O75147 1896 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 GABRDO14764 452 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 RHOP08100 348 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TRIM49P0CI25 452 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TRIM49CP0CI26 452 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CCNE1P24864 410 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PCSK1P29120 753 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ALDH1A3P47895 512 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 VNN1O95497 513 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ASGR2P07307 311 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PIK3CAP42336 1068 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CDR1P51861 262 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 EPHB3P54753 998 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SV2AQ7L0J3 742 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CEP72Q9P209 647 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 HCRTO43612 131 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 BMP6P22004 513 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MTMR3Q13615 1198 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ITFG1Q8TB96 612 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 FGF13Q92913 245 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ASAH2Q9NR71 780 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CDH7Q9ULB5 785 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TACC1O75410 805 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SOAT2O75908 522 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 LAMP2P13473 410 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 GCLMP48507 274 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 ING5Q8WYH8 240 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SYT15Q9BQS2 421 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SNX25Q9H3E2 840 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 ZXDAP98168 799 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 PPP3CAQ08209 521 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 VEPH1Q14D04 833 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 LEMD2Q8NC56 503 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 NELFBQ8WX92 580 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 EDAQ92838 391 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 PKMYT1Q99640 499 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 CDH9Q9ULB4 789 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 TECTAO75443 2155 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 MYH10P35580 1976 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 BICDL2A1A5D9 508 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 ZNF197O14709 1029 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 HLA-DRAP01903 254 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 P4HA1P13674 534 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 ATF6P18850 670 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 LMO2P25791 158 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 ITIH5Q86UX2 942 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-208ENST00000481121 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.25■■□□□ 1.15
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