RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 KCND2Q9NZV8 630 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.33□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 OR6C75A6NL08 312 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SMAPO00193 183 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DTNBO60941 627 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KCNK5O95279 499 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ADRB2P07550 413 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CPB1P15086 417 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 LIG1P18858 919 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CYP3A5P20815 502 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PAX3P23760 479 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HOXC13P31276 330 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MCM4P33991 863 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 NPTX2P47972 431 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SOX9P48436 509 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PTPAQ15257 358 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KRT79Q5XKE5 535 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CENPPQ6IPU0 288 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CEP68Q76N32 757 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 VPS45Q9NRW7 570 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATRXP46100 2492 aa8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PTPRDP23468 1912 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TTC26A0AVF1 554 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SOBPA7XYQ1 873 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C3orf80F5H4A9 247 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 EXTL3O43909 919 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATG13O75143 517 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TOM1L1O75674 476 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TYMPP19971 482 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ALDH1A3P47895 512 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 EPHB3P54753 998 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PEX3P56589 373 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 OSTNP61366 133 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MCL1Q07820 350 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP4Q13115 394 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MAPK7Q13164 816 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PON2Q15165 354 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MCTP1Q6DN14 999 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZPBP2Q6X784 338 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KBTBD6Q86V97 674 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TATDN2Q93075 761 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CHFRQ96EP1 664 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM209Q96SK2 561 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 POLD4Q9HCU8 107 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CACNA1GO43497 2377 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MTMR11A4FU01 709 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PRAMEF12O95522 483 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CYP11A1P05108 521 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GUCY2CP25092 1073 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GABRR2P28476 465 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ABCD1P33897 745 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MPLP40238 635 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PLK5Q496M5 336 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms