RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	BIRC3	Q13489	604 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC142	Q17RM4	750 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	POTEH	Q6S545	545 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	FGF14	Q92915	247 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	GSDMA	Q96QA5	445 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ACBD6	Q9BR61	282 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ASAH2	Q9NR71	780 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	GJA1	P17302	382 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	NXPE3	Q969Y0	559 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF197	O14709	1029 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	GABRD	O14764	452 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	AKAP3	O75969	853 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PRCP	P42785	496 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	LHX1	P48742	406 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	CLDN10	P78369	228 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	NFIL3	Q16649	462 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	DPH6	Q7L8W6	267 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA18	Q8TC71	538 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	CLSTN1	O94985	981 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ATF6	P18850	670 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SMARCB1	Q12824	385 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ISM2	Q6H9L7	571 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA20	Q8TB22	786 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	TMC2	Q8TDI7	906 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		31.39	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MOSPD3	O75425	235 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	LMO2	P25791	158 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PCSK1	P29120	753 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	AP3M2	P53677	418 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	EPHA5	P54756	1037 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	TNNC1	P63316	161 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM9	Q13443	819 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	MTSS1L	Q765P7	747 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	TMC8	Q8IU68	726 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	GIPC2	Q8TF65	315 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	KXD1	Q9BQD3	176 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC3	Q9BY71	257 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	GDE1	Q9NZC3	331 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP2C2	O75185	946 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	VNN1	O95497	513 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	CFH	P08603	1231 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	VAMP7	P51809	220 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	NCOA4	Q13772	614 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	LEMD2	Q8NC56	503 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMG2	Q969U7	264 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PKMYT1	Q99640	499 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	SYT15	Q9BQS2	421 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	ASB3	Q9Y575	518 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PDGFRB	P09619	1106 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	ATIC	P31939	592 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	TEAD2	Q15562	447 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXL6	Q8N531	539 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR152	Q8TDT2	470 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1W2PRU2	124 aa		31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	MAPK13	O15264	365 aa		31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM49	P0CI25	452 aa		31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM49C	P0CI26	452 aa		31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	SRF	P11831	508 aa		31.35	■■■□□ 2.61
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61

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