RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 STX10O60499 249 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 LMO2P25791 158 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ELF1P32519 619 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 PIK3CAP42336 1068 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 MXI1P50539 228 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 MYL7Q01449 175 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 SEMA4DQ92854 862 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 PRRG1O14668 218 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CCL16O15467 120 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 GNA14O95837 355 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 DUSP4Q13115 394 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SDCBP2Q9H190 292 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CD320Q9NPF0 282 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 NOTCH4Q99466 2003 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CDH8P55286 799 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 TSPY1Q01534 308 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SMARCB1Q12824 385 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC142Q17RM4 750 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 RAB20Q9NX57 234 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 DACH1Q9UI36 760 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PCSK1P29120 753 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 ASPAP45381 313 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CDR1P51861 262 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM171BQ6P995 826 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 BCO2Q9BYV7 579 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CDH9Q9ULB4 789 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 YIPF1Q9Y548 306 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PMM2O15305 246 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP2C2O75185 946 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 RAP1GAPP47736 663 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 FMO5P49326 533 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SYT15Q9BQS2 421 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SNX25Q9H3E2 840 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PIDD1Q9HB75 910 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CEP72Q9P209 647 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CLUHO75153 1309 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 XYLBO75191 536 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 LRG1P02750 347 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PDGFRBP09619 1106 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC192P0DO97 292 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 P4HA1P13674 534 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 NTHL1P78549 312 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 TWF1Q12792 350 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SOAT2O75908 522 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms