RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 THEGQ9P2T0 379 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CD207Q9UJ71 328 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 C5orf42Q9H799 3197 aa11.79□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 MTMR11A4FU01 709 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 OR6C75A6NL08 312 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 MBTPS2O43462 519 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 GNA14O95837 355 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 C8AP07357 584 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC192P0DO97 292 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP1A3P13637 1013 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CD58P19256 250 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CREMQ03060 361 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 DUSP4Q13115 394 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPN21Q16825 1174 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 PDXDC1Q6P996 788 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 GJB7Q6PEY0 223 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SMRP1Q8NCR6 262 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 GPR152Q8TDT2 470 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 WHAMMQ8TF30 809 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SYT15Q9BQS2 421 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 DSEQ9UL01 958 aa11.78□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 NOTCH4Q99466 2003 aa11.77□□□□□ -0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CLDN5O00501 218 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 NCK2O43639 380 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 STX10O60499 249 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TACC1O75410 805 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ZMYND10O75800 440 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ATF2P15336 505 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC9A1P19634 815 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PTMSP20962 102 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 NDST1P52848 882 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CACNA2D1P54289 1103 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 MYL5Q02045 173 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 GPR17Q13304 367 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 IQCB1Q15051 598 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KRT31Q15323 416 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 RRAGAQ7L523 313 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ACOT1Q86TX2 421 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 BCO2Q9BYV7 579 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 VPS16Q9H269 839 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SNX25Q9H3E2 840 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CBX8Q9HC52 389 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 COG5Q9UP83 839 aa11.77□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MXQ7 604 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PRRG1O14668 218 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 BMP1P13497 986 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF18P17022 549 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PAX3P23760 479 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP2F1P24903 491 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 LHX1P48742 406 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KLK7P49862 253 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF165P49910 485 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNMA1Q12791 1236 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 MAN2A1Q16706 1144 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 VWA3BQ502W6 1294 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF394Q53GI3 561 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM171BQ6P995 826 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 POTEHQ6S545 545 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 DPH6Q7L8W6 267 aa11.76□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms