RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 FGF14Q92915 247 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 RMND1Q9NWS8 449 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 CDH7Q9ULB5 785 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 MAFFQ9ULX9 164 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.53□□□□□ -0.56
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ANHXE9PGG2 379 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 BIN1O00499 593 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MAPK13O15264 365 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 KIF20AO95235 890 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 VAMP7P51809 220 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 EPHA5P54756 1037 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 CDH8P55286 799 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2HP62256 183 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PPP3CAQ08209 521 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 BIRC3Q13489 604 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 HTR4Q13639 388 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 NCOA4Q13772 614 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ZACNQ401N2 412 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SV2AQ7L0J3 742 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 STKLD1Q8NE28 680 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TMC2Q8TDI7 906 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 GPR152Q8TDT2 470 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ACBD6Q9BR61 282 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SDCBP2Q9H190 292 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.52□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM221A6NGB7 291 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 M0R296 226 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PDGFRBP09619 1106 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MYL4P12829 197 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 CYP2F1P24903 491 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 RAP1GAPP47736 663 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 GCLMP48507 274 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 LHX1P48742 406 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MYL7Q01449 175 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TRPC3Q13507 836 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MTMR3Q13615 1198 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MORC3Q14149 939 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 CAMK4Q16566 473 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 IER5LQ5T953 404 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 FAM171BQ6P995 826 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 DPH6Q7L8W6 267 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 GIPC2Q8TF65 315 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 MMS19Q96T76 1030 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PRR33A8MZF0 331 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 IKBKBO14920 756 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 PHACTR2O75167 634 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TACC1O75410 805 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DRAP01903 254 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 FCARP24071 287 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ATICP31939 592 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 ALDH1A3P47895 512 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 AP3M2P53677 418 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TSPY1Q01534 308 aa11.5□□□□□ -0.57
ATG4B-210ENST00000428861 TDGQ13569 410 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms