RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 KIZQ2M2Z5 673 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GANCQ8TET4 914 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CNDP1Q96KN2 507 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ITM2BQ9Y287 266 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MICU2Q8IYU8 434 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LPAR1Q92633 364 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CARD9Q9H257 536 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PDGFRAP16234 1089 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DDR1Q08345 913 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 AFG1LQ8WV93 481 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 VPS50Q96JG6 964 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RRAGCQ9HB90 399 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HMOX2P30519 316 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PTK2BQ14289 1009 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KRT72Q14CN4 511 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SBK1Q52WX2 424 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 AP5Z1O43299 807 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 COPAP53621 1224 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KCNMA1Q12791 1236 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PDIA5Q14554 519 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SH3GL2Q99962 352 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1W2PQJ5 194 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ASB14A6NK59 587 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MYO1DO94832 1006 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM253P0C7T8 217 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TLR2O60603 784 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NFIAQ12857 509 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LAMB3Q13751 1172 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 WDR93Q6P2C0 686 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DONSONQ9NYP3 566 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP9O95302 570 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DLGAP3O95886 979 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RALAP11233 206 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CETPP11597 493 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RASA1P20936 1047 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINB9P50453 376 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRN2Q92932 1015 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EPAS1Q99814 870 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 UBOX5O94941 541 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NFKBIAP25963 317 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SULT1E1P49888 294 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SFNP31947 248 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ANTXR2P58335 489 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TPI1P60174 286 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF543Q08ER8 600 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ITIH4Q14624 930 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC103Q8IW40 242 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA18Q8TC71 538 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NYAP2Q9P242 653 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1G2O95670 118 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM162AQ96A26 154 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 WNK4Q96J92 1243 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM167AQ96KS9 214 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms