RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP68Q76N32 757 aa14.25□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.25□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALML4Q96GE6 196 aa14.25□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD2Q9Y426 696 aa14.25□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.24□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.24□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.24□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BQV1 296 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB561D2O14569 222 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCB1Q12824 385 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPAQ15257 358 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF12Q16514 161 aa14.23□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADALQ6DHV7 355 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIPC2Q8TF65 315 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPOCK2Q92563 424 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD54LQ92698 747 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.23□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TISP43B9A030 160 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXTL3O43909 919 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCG1P19174 1290 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJB2P29033 226 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCM6Q14566 821 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPS4Q9NQG7 708 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPP3Q9NY33 737 aa14.22□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVPR1AP37288 418 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUNX3Q13761 415 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SV2CQ496J9 727 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WSCD1Q658N2 575 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAB3Q8WWW8 586 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHFRQ96EP1 664 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF560Q96MR9 790 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GKN1Q9NS71 199 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL26Q9Y258 94 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EML5Q05BV3 1969 aa14.21□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPN2O95208 641 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F11P03951 625 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP12P59046 1061 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN1Q05586 938 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BFSP1Q12934 665 aa14.2□□□□□ -0.14
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