RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300		I3L4J1	428 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300		M0QYV0	167 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MESD	Q14696	234 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UPP1	Q16831	310 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	VDR	P11473	427 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SCN5A	Q14524	2016 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300		F8W810	466 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300		O00370	1275 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ENPP3	O14638	875 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MICAL2	O94851	1124 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GJB6	O95452	261 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	EOMES	O95936	686 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP1A2	P05177	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MMP8	P22894	467 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GRIK3	Q13003	919 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SEPT8	Q92599	483 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PIK3R2	O00459	728 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	COL6A1	P12109	1028 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TUSC3	Q13454	348 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CNGA2	Q16280	664 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LIN9	Q5TKA1	542 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TOX2	Q96NM4	488 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNK3	O14649	394 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP2C2	O75185	946 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGB1	P05556	798 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MYBL1	P10243	752 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC130	P13994	396 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	BRCC3	P46736	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM189B	P81408	668 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	B4GALT3	O60512	393 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DDHD2	O94830	711 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ADORA2B	P29275	332 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GPD2	P43304	727 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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