RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 C4orf22Q6V702 233 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 UBA3Q8TBC4 463 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 CASZ1Q86V15 1759 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 B2RBV5 119 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 CASP2P42575 452 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 KLC1Q07866 573 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 E2F7Q96AV8 911 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 16.7
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP9BO43861 1147 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 CUL3Q13618 768 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 HYIQ5T013 277 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 CHEK2O96017 543 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC4A1P02730 911 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ECM1Q16610 540 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC6Q86X45 466 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TTC8Q8TAM2 541 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 KRT35Q92764 455 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 HPDLQ96IR7 371 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF263O14978 683 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 HBP1O60381 514 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ZBTB7AO95365 584 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 POU5F1BQ06416 359 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF19Q2TAC6 998 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 EXT2Q93063 718 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJC18Q9H819 358 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PSMD10O75832 226 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MYL3P08590 195 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FSBPO95073 299 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SULT1E1P49888 294 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PGM5Q15124 567 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP3CAQ08209 521 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 OVGP1Q12889 678 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 NPY5RQ15761 445 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 AGR3Q8TD06 166 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 SCFD2Q8WU76 684 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MTBPQ96DY7 904 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MED15Q96RN5 788 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 THTPAQ9BU02 230 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ERFP50548 548 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 DACT2Q5SW24 774 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-201ENST00000389413 TEX9Q8N6V9 391 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms