RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 KPNA5O15131 536 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VAMP1P23763 118 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CARD18P57730 90 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VSNL1P62760 191 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ8Q15842 424 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FSCBQ5H9T9 825 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ITIH5Q86UX2 942 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RASEFQ8IZ41 740 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CARFQ8N187 725 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RADILQ96JH8 1075 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HYPKQ9NX55 129 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RRN3Q9NYV6 651 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CPA4Q9UI42 421 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX6Q9UNH7 406 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MUI8 341 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SSX5O60225 188 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 COBLO75128 1261 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 TXKP42681 527 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM17P78536 824 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HOMER1Q86YM7 354 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 GAB3Q8WWW8 586 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DACT1Q9NYF0 836 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SHOXO15266 292 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH1A2O94788 518 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 ODF1Q14990 250 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFBIQ15582 683 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DUPD1Q68J44 220 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZNX1 250 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO27Q8NI29 283 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP5Q96PP8 586 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3GL2Q99962 352 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH7Q9H992 704 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 BAG2O95816 211 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ARSHQ5FYA8 562 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TINAGQ9UJW2 476 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A088AWK7 358 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3D21A4FU49 640 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.16□□□□□ -1.26
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