RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377208.6

POU4F1-201, Transcript of POU class 4 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene POU4F1, Length 4,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1-201ENST00000377208 PAPPAQ13219 1627 aa22.95■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.95■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 HELQQ8TDG4 1101 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 CHRNB2P17787 502 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RGS7P49802 495 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 SNX3O60493 162 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 LYPLA2O95372 231 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 STAMBPO95630 424 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MED10Q9BTT4 135 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 OGTO15294 1046 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 KRT38O76015 456 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PTGER2P43116 358 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RAD23BP54727 409 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 EMC1Q8N766 993 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ACTL9Q8TC94 416 aa22.94■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 KCNN4O15554 427 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 SAT1P21673 171 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PTGIRP43119 386 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ATG16L1Q676U5 607 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 FZD1Q9UP38 647 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 F8VP50 259 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 APRTP07741 180 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 UBA3Q8TBC4 463 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PLA2G6O60733 806 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MAMLD1Q13495 774 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 IER5Q5VY09 327 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 OTUD5Q96G74 571 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.93■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 OVGP1Q12889 678 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 BSNDQ8WZ55 320 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PLSCR1O15162 318 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TNFAIP2Q03169 654 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MCL1Q07820 350 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TBC1D12O60347 775 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ATP6V1G2O95670 118 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 LONP2Q86WA8 852 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MORF4L2Q15014 288 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TLCD1Q96CP7 247 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 BORCS6Q96GS4 357 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 SNX25Q9H3E2 840 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PHLPP1O60346 1717 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ETS1P14921 441 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 CCND1P24385 295 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TAS2R40P59535 323 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PTK7Q13308 1070 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZACNQ401N2 412 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 HAO1Q9UJM8 370 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 O00370 1275 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PPCSQ9HAB8 311 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 TXNDC9O14530 226 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RPTORQ8N122 1335 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 MAP3K6O95382 1288 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PEX5P50542 639 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 GGA3Q9NZ52 723 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 ADSSP30520 456 aa22.9■■□□□ 1.26
POU4F1-201ENST00000377208 RAP1GAPP47736 663 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms