RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CORO1BQ9BR76 489 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PSMA7O14818 248 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 WARSP23381 471 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CCR2P41597 374 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN21Q16825 1174 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF699Q32M78 642 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 DPH6Q7L8W6 267 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TCEAL4Q96EI5 215 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ACBD6Q9BR61 282 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CLSTN2Q9H4D0 955 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SMYD3Q9H7B4 428 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1468Q9P260 1216 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.92■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 NCOR1O75376 2440 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 IKBKBO14920 756 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LRRN2O75325 713 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 KRT13P13646 458 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ATF6P18850 670 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ATICP31939 592 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 RAP1GAPP47736 663 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TNNC1P63316 161 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MYL7Q01449 175 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TSPY1Q01534 308 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC63Q05C16 580 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TTI2Q6NXR4 508 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA18Q8TC71 538 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 RSAD2Q8WXG1 361 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 FGF13Q92913 245 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SDCBP2Q9H190 292 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 VRTNQ9H8Y1 702 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.91■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-DRAP01903 254 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 EPB41P11171 864 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ALADP13716 330 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CEBPBP17676 345 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN2P17706 415 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LHX1P48742 406 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 GPR15P49685 360 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MGAT5BQ3V5L5 792 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS36Q5K4E3 855 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 NPAS3Q8IXF0 933 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 NELFBQ8WX92 580 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LPIN3Q9BQK8 851 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PI4K2AQ9BTU6 479 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.9■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CLSTN1O94985 981 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PDGFRBP09619 1106 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LAMP2P13473 410 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3CAP42336 1068 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 STX17P56962 302 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 STIM1Q13586 685 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 STKLD1Q8NE28 680 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SYT15Q9BQS2 421 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC3Q9BY71 257 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.227e-7■■■■■ 52.7
TPGS1-201ENST00000359315 CDH7Q9ULB5 785 aa28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TACC1O75410 805 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MOSPD3O75425 235 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GJA1P17302 382 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PCSK1P29120 753 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CDH8P55286 799 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF667Q5HYK9 610 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 TMC8Q8IU68 726 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SPPL2BQ8TCT7 592 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 DPEP3Q9H4B8 488 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 KCNK12Q9HB15 430 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa28.88■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MYL4P12829 197 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH1A3P47895 512 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZXDAP98168 799 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ENPEPQ07075 957 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 IQCEQ6IPM2 695 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ELMOD1Q8N336 334 aa28.87■■■□□ 2.21
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