RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345254.8

SEC24C-202, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24C, Length 4,433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-202ENST00000345254 MIS12Q9H081 205 aa10.01□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 USP20Q9Y2K6 914 aa10.01□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ZNF536O15090 1300 aa10.01□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 RPA1P27694 616 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 EPHB3P54753 998 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 CRYMQ14894 314 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 MEI1Q5TIA1 1274 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TLR10Q9BXR5 811 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 HAUS2Q9NVX0 235 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 NHSQ6T4R5 1651 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SOX5P35711 763 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ITIH4Q14624 930 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 CATSPER3Q86XQ3 398 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 GBP5Q96PP8 586 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 VCX3BQ9H321 246 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 RAB20Q9NX57 234 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ITGB5P18084 799 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 MLH1P40692 756 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPDYCQ5MJ68 293 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ZNF618Q5T7W0 954 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 WDR59Q6PJI9 974 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PITPNM3Q9BZ71 974 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TTI1O43156 1089 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 GJA8P48165 433 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 RABGGTBP53611 331 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ARMC2Q8NEN0 867 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ERP44Q9BS26 406 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SUFUQ9UMX1 484 aa10□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PLA2G6O60733 806 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 GLI1P08151 1106 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TMEM253P0C7T8 217 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 RALAP11233 206 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 CCND1P24385 295 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TAF6P49848 677 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPARCL1Q14515 664 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 GPD1LQ8N335 351 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 STK33Q9BYT3 514 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ODC1P11926 461 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PLS3P13797 630 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 CHN1P15882 459 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 LAG3P18627 525 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PEX19P40855 299 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPATA24Q86W54 205 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 HPS3Q969F9 1004 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPON2Q9BUD6 331 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 EHD2Q9NZN4 543 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SPTBN2O15020 2390 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 A0A087X0T9 212 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PHF2O75151 1096 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 FAM228BP0C875 321 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PPP2R5DQ14738 602 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 LRRC43Q8N309 656 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 STKLD1Q8NE28 680 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 FLCNQ8NFG4 579 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-202ENST00000345254 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms