RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FAXCQ5TGI0 409 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 STYK1Q6J9G0 422 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 LAYNQ6UX15 382 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SLC37A4O43826 429 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SREBF2Q12772 1141 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RNF180Q86T96 592 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RIT2Q99578 217 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CNGA3Q16281 694 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MROH9Q5TGP6 573 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 LAMB3Q13751 1172 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP73A6NFT4 308 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 M0QYT0 321 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PMPCBO75439 489 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RAP1GDS1P52306 607 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K6O95382 1288 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 PGK2P07205 417 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RPA1P27694 616 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RGS4P49798 205 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MED21Q13503 144 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MSH4O15457 936 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC157Q569K6 752 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF556Q9HAH1 456 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A5Q14940 896 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 WDCPQ9H6R7 721 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MED14O60244 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 VTNP04004 478 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RAP1GAPP47736 663 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CCZ1BP86790 482 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 PTGER2P43116 358 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SGF29Q96ES7 293 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KYNUQ16719 465 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CALML6Q8TD86 181 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN7P35236 360 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD6Q53TS8 623 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN1Q05586 938 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 EPN3Q9H201 632 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ALG6Q9Y672 507 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 HEATR9A2RTY3 570 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K10Q02779 954 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 HORMAD1Q86X24 394 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 WNK4Q96J92 1243 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 8.5
PTPRM-201ENST00000332175 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ENDOD1O94919 500 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CHI3L2Q15782 390 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf89Q6UX73 402 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 DDIT4Q9NX09 232 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.3■■□□□ 1.32
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