RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.02□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DTNBO60941 627 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TOM1L1O75674 476 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SOAT2O75908 522 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CTDNEP1O95476 244 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 OR52Z1P0C646 297 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CYP3A5P20815 502 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PAX3P23760 479 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PDGFRLQ15198 375 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DRC1Q96MC2 740 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TDP1Q9NUW8 608 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 STK24Q9Y6E0 443 aa13.01□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SPEGQ15772 3267 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ABLIM1O14639 778 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CLDN3O15551 220 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 LARGE1O95461 756 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CLTAP09496 248 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ODC1P11926 461 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 FDPSP14324 419 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 LMAN2Q12907 356 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PMS2CLQ68D20 193 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TTC9BQ8N6N2 239 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DEFB124Q8NES8 71 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TSTD1Q8NFU3 115 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 LPIN3Q9BQK8 851 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 IL21Q9HBE4 155 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 EML5Q05BV3 1969 aa13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 HIP1RO75146 1068 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CXCL8P10145 99 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SMTNP53814 917 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 IRX4P78413 519 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SPAG1Q07617 926 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SMARCB1Q12824 385 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PSMD2Q13200 908 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD1Q15327 319 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB6Q15916 424 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 KYAT1Q16773 422 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SEZ6Q53EL9 994 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ZPBP2Q6X784 338 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CPA6Q8N4T0 437 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MAB21L3Q8N8X9 362 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 CHFRQ96EP1 664 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TBX20Q9UMR3 447 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DNM3Q9UQ16 869 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 INVSQ9Y283 1065 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.99□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 LAMA1P25391 3075 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TTC26A0AVF1 554 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 H0Y626 953 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TAF4O00268 1085 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 SLC16A4O15374 487 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 TRIM16O95361 564 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ARSAP15289 507 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 GJA4P35212 333 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 PPP2R3AQ06190 1150 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 MCL1Q07820 350 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 NR1H3Q13133 447 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 NFKBIBQ15653 356 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ZNF174Q15697 407 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 ECM1Q16610 540 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.98□□□□□ -0.33
SPC25-201ENST00000282074 DAW1Q8N136 415 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms