RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 PYGLP06737 847 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CCDC142Q17RM4 750 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BTBD7Q9P203 1132 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CYP27B1O15528 508 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SYBUQ9NX95 663 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PTPN4P29074 926 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ADORA2BP29275 332 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FAM167AQ96KS9 214 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 Q4G0T1 1027 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MIEF2Q96C03 454 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MAML3Q96JK9 1138 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ATP6V1E1P36543 226 aa10.63□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MYOM1P52179 1685 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 IFNA8P32881 189 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SP110Q9HB58 689 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CATSPER4Q7RTX7 472 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PSTPIP1O43586 416 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CNKSR1Q969H4 720 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TTI2Q6NXR4 508 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 LAYNQ6UX15 382 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PID1Q7Z2X4 250 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FUKQ8N0W3 1084 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TRAPPC3O43617 180 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FAM196BA6NMK8 535 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BLVRAP53004 296 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 UGP2Q16851 508 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MAP2K7O14733 419 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 HUS1O60921 280 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NCOA4Q13772 614 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 WNK4Q96J92 1243 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CDC25CP30307 473 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 AQP5P55064 265 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NUP107P57740 925 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RUNX1T1Q06455 604 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 IYDQ6PHW0 289 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 LRRC6Q86X45 466 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EHD4Q9H223 541 aa10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ASNA1O43681 348 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RFC5P40937 340 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PTPRN2Q92932 1015 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FAM162AQ96A26 154 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CST8O60676 142 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TTC39CQ8N584 583 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BEST2Q8NFU1 509 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 COA1Q9GZY4 146 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CASS4Q9NQ75 786 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TAF4O00268 1085 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 GRAP2O75791 330 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TMEM165Q9HC07 324 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 KCND1Q9NSA2 647 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 OTULINQ96BN8 352 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RSAD1Q9HA92 442 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 AP3M2P53677 418 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ABI1Q8IZP0 508 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms