RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Plagl1Q9JLQ4 704 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lipo2D3YY49 398 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mmp3P28862 477 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ZbbxQ0P5X5 716 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q5XFZ0 217 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rassf2Q8BMS9 326 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q8BWG4 1187 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Taf5Q8C092 801 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 McmbpQ8R3C0 642 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CarfQ8VHI4 689 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Asb7Q91ZU0 318 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 GgcxQ9QYC7 757 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa9.64□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tldc2A2ACG1 198 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm3415J3QMS8 315 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gnl1P36916 607 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rbp3P49194 1234 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Psmc1P62192 440 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nfe2Q07279 373 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kansl1lQ5DTI6 991 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Atg9bQ6EBV9 922 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zcwpw1Q6IR42 630 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ints6lQ8BND4 861 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 RalylQ8BTF8 293 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Uba6Q8C7R4 1053 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mcoln2Q8K595 566 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 KynuQ9CXF0 464 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm3404Q9D506 307 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ThadaA8C756 1938 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc4a11A2AJN7 862 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Plekha5E9Q6H8 1269 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tspyl1O88852 379 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fcer2P20693 331 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PrkchP23298 683 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SftpdP50404 374 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zscan2Q07230 614 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Samhd1Q60710 627 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zswim6Q80TB7 1207 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phf8Q80TJ7 1023 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Wscd1Q80XH4 572 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem260Q8BMD6 703 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Def6Q8C2K1 630 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Trpv6Q91WD2 767 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PtgisO35074 501 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 DffaO54786 331 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 NfkbieO54910 364 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 RarbP22605 482 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ephb4P54761 987 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lhx5P61375 402 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sox8Q04886 464 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Trmt1Q3TX08 663 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Enoph1Q8BGB7 257 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phka2Q8BWJ3 1235 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q922R1 422 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q9CQC3 228 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam212aQ9CX62 282 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pramef12Q9D2F1 463 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gstt4Q9D4P7 240 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nfu1Q9QZ23 255 aa9.63□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ZxdbA2CE44 873 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 6030498E09RikB1AX85 169 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PdgfraP26618 1089 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cetn1P41209 172 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hsd17b2P51658 381 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sesn2P58043 480 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MagohP61327 146 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hoxb13P70321 286 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pid1Q3UBG2 217 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ttc9Q3V038 219 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PoliQ6R3M4 717 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gja6Q6S5G4 283 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 March4Q80TE3 409 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Bicd1Q8BR07 835 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rccd1Q8BTU7 377 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Efl1Q8C0D5 1127 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sh3rf3Q8C120 878 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Snrnp25Q8VIK1 123 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Chst12Q99LL3 419 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MagohbQ9CQL1 146 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Thap12Q9CUX1 758 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Drc3Q9D5E4 523 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ParvaQ9EPC1 372 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Myo16Q5DU14 1919 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mmrn1B2RPV6 1210 aa9.62□□□□□ -0.87
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Itgb3O54890 787 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.2 ms