RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCR022CP25620 114 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRP17P28778 131 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPT14P32363 452 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SUA5P32579 426 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YKL162CP36052 402 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBL071CP38185 102 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PTC7P38797 343 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SNF11P38956 169 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM20P40451 204 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POR2P40478 281 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LCB3P47013 409 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSM1P47017 172 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJR015WP47090 510 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSO1P53604 210 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FYV6P53913 173 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 COX12Q01519 83 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ODC1Q03028 310 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DCS1Q06151 350 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATG39Q06159 398 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRT7Q07829 113 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TIM18Q08749 192 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCT1Q12235 531 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POM34Q12445 299 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 COA2Q3E823 68 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PIS1P06197 220 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHR213WP0CI67 198 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ZRC1P20107 442 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCR001WP25347 104 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TIR2P33890 251 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CMC1P36064 111 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SHB17P36136 271 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CSH1P38287 376 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BDH1P39714 382 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GLE2P40066 365 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YER135CP40082 130 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YKE4P40544 346 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RTS2P40962 232 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GPI2P46961 280 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATG27P46989 271 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GNP1P48813 663 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NIF3P53081 288 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TPN1P53099 579 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GPG1P53130 126 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YAP1802P53309 568 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HCH1P53834 153 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDR17P53844 350 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIF1P53845 314 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SMX3P54999 86 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HAL1Q01766 294 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UBC7Q02159 165 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FRQ1Q06389 190 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PHO92Q06390 306 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ARR3Q06598 404 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ENV7Q12003 364 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RAD28Q12021 506 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TRM13Q12383 476 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM45Q12480 344 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YLR146W-AQ2V2P1 62 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC7P06243 507 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ARG80P07249 177 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NHP6BP11633 99 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GCN3P14741 305 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MLF3P32047 452 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ECM25P32525 599 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UPS2P35200 230 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL3P36516 390 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBR242WP38331 238 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HUA1P40325 198 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HXT14P42833 540 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJR111CP47148 283 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PKP2P53170 491 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YGR018CP53211 109 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIP3P53633 176 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GPI15P53961 229 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DID2P69771 204 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TIM44Q01852 431 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SDH7Q04401 133 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LDS2Q08218 356 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOL160WQ08321 113 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPL264CQ08980 353 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPS3Q12303 508 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ERS1P17261 260 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCR025CP25352 136 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POP5P28005 173 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PHD1P36093 366 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSM2P38203 95 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VMA22P38784 181 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MIG3P39943 394 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIL077CP40508 320 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YFR035CP43608 114 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MIC27P50945 234 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SHH3Q04487 196 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CTR3Q06686 241 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 STP4Q07351 490 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AYT1Q12226 474 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TAL1P15019 335 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms