RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	PDR17	P53844	350 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	IZH1	Q03419	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SEN15	Q04675	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RFU1	Q08003	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATG5	Q12380	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	FUN14	P18411	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	QCR9	P22289	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	PHD1	P36093	366 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SHO1	P40073	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	CUP9	P41817	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	PGU1	P47180	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	COQ11	Q05892	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	MHR1	Q06630	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATX2	Q12067	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RIP1	P08067	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SEC62	P21825	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SPO13	P23624	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SWD3	P38123	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	COX15	P40086	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RTS2	P40962	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	OST3	P48439	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	APS2	Q00381	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATC1	Q04005	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	TSA2	Q04120	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	FYV7	Q12247	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	FLO9	P39712	1322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATP10	P18496	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	REE1	P40893	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	TTI2	P47168	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	LST7	P53237	242 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	HCH1	P53834	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	EOS1	P53938	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	PIN3	Q06449	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATP5	P09457	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SAG1	P20840	650 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YKL075C	P36083	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YGR269W	P40326	108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YPS6	P40583	537 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YML122C	Q03207	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	SDC1	Q03323	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	HRD1	Q08109	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YBL059W	P34224	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YIL029C	P40538	142 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	GEP7	P53171	287 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YGR050C	P53231	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	DAD3	P69850	94 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ARR2	Q06597	130 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ATG40	Q99325	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MCH2	P36032	473 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	CYB5	P40312	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	GPI2	P46961	280 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RIM9	Q04734	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	UPS1	Q05776	175 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	FCY2	P17064	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YCR007C	P25354	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	IMP1	P28627	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	QDR3	P38227	689 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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