RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	PAU20	Q08322	120 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	IRC13	Q08630	104 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ORT1	Q12375	292 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	PAU9	Q3E770	120 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	COX1	P00401	534 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	GAL7	P08431	366 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RNQ1	P25367	405 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ZRT1	P32804	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YOR062C	P36025	268 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	CMC1	P36064	111 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YER085C	P40058	173 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YIL060W	P40519	144 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	HIT1	P46973	164 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	BNA1	P47096	177 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ERG25	P53045	309 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	EMC4	P53073	190 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YGL230C	P53074	147 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SGF73	P53165	657 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YGR015C	P53208	328 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	LST7	P53237	242 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	DUG3	P53871	357 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SNO4	Q04902	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FSH2	Q05015	223 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SYM1	Q06563	197 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	HSP32	Q08992	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	PFA4	Q12006	378 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FCY22	Q12119	530 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	VAR1	P02381	398 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SCO1	P23833	295 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	PCL1	P24867	279 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	TRX3	P25372	127 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	DER1	P38307	211 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	PSD1	P39006	500 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	OXA1	P39952	402 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YER121W	P40076	114 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YER134C	P40081	178 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	HAC1	P41546	238 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SNO3	P43544	222 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	CAB4	P53332	305 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	DAD3	P69850	94 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SKO1	Q02100	647 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	IZH1	Q03419	316 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	DPP1	Q05521	289 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ARR3	Q06598	404 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ENB1	Q08299	606 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	PRM3	Q08931	133 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YOS1	Q3E834	85 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ODC2	Q99297	307 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YLR415C	O13578	112 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RAD6	P06104	172 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YGL010W	P25338	174 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	HXT4	P32467	576 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SDS24	P38314	527 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	ATX1	P38636	73 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	INM1	P38710	295 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FLO5	P38894	1075 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	TEM1	P38987	245 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	CDC1	P40986	491 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YCH1	P42937	148 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YFL065C	P43539	102 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YJL028W	P47062	111 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YLR460C	P54007	376 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	UBC7	Q02159	165 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	NRG1	Q03125	231 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YMR210W	Q03649	449 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	INP1	Q03694	420 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	LIP2	Q06005	328 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	STP4	Q07351	490 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	MCT1	Q12283	360 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	SEC11	P15367	167 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SOD1	YJR104C	FCY2	P17064	533 aa		3.03	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.6 ms