RNA–Protein interactions for RNA: YJL138C

TIF2, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF2	YJL138C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	YBR063C	P38083	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	MIG3	P39943	394 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	FLX1	P40464	311 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	POG1	P40473	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	IGD1	P43598	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	NNT1	Q05874	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	RPL39	P04650	51 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	TFC1	P32367	649 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	POP8	P38208	133 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	FIG1	P38224	298 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	SRP14	P38985	146 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	UFD1	P53044	361 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	NUP49	Q02199	472 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	COX5B	P00425	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	PHO80	P20052	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	CTR2	P38865	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	SPO73	P40031	143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	PDR17	P53844	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	AAH1	P53909	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	YML108W	Q03759	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	GPI17	Q04080	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	TRM10	Q12400	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	YJR056C	P47115	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	ILM1	P47155	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	BXI1	P48558	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	ELP6	Q04868	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	SPC2	Q04969	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	QCR2	P07257	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	MRPS28	P21771	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	ERG2	P32352	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	XPT1	P47165	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	MRH4	P53166	561 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	ARR2	Q06597	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	RFU1	Q08003	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF2	YJL138C	GCN3	P14741	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	SPS18	P32572	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	AVT6	P40074	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	OST3	P48439	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	PRM8	P53174	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	LOA1	Q06508	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	RMD6	P39975	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	FAR7	P43592	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YGL118C	P53132	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YIP3	P53633	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	APJ1	P53940	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	SPC24	Q04477	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YNG1	Q08465	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YCR025C	P25352	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	MRX8	Q05473	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	RIB3	Q99258	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	PCL1	P24867	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	IPT1	P38954	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	CCC1	P47818	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YGL262W	P53054	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	PGA1	P53896	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	PUT1	P09368	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	MRPL28	P36527	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	GON7	P46984	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YGR018C	P53211	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	ZRT3	P34240	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	ECM31	P38122	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	AME1	P38313	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	RRG9	P40156	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	AGE2	P40529	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	NRK1	P53915	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	COG5	P53951	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	SNO1	Q03144	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	VPS71	Q03433	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	GAL83	Q04739	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF2	YJL138C	SGA1	P08019	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	APS1	P35181	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	KRE9	P39005	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF2	YJL138C	BOR1	P53838	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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