RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SRL1	Q08673	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	DYN1	P36022	4092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	FCY2	P17064	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	WSS1	P38838	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YGR269W	P40326	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SNX4	P47057	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	BUL1	P48524	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	INO2	P26798	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	UPS2	P35200	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	HXT14	P42833	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SRB7	P47822	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	DUG3	P53871	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	MSA1	Q08471	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ATP14	Q12349	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	AGC1	Q12482	902 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YCR041W	P37265	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	QDR3	P38227	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	VMA7	P39111	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	PHO23	P50947	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ERG25	P53045	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YHP1	Q04116	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	NDE2	Q07500	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RAD28	Q12021	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RKI1	Q12189	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	POM34	Q12445	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	AHT1	P29589	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YPS1	P32329	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	DAL3	P32459	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YAR068W	P39564	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	TAX4	P47030	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	UBC12	P52491	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YGR018C	P53211	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	IRC23	Q08416	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ELO2	P25358	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YCR022C	P25620	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	CDC50	P25656	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	FPR2	P32472	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	CSH1	P38287	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	FLO5	P38894	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SYG1	P40528	902 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	EMC5	P40540	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YJR015W	P47090	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YGR219W	P53307	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YNR066C	P53752	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ADD37	Q03233	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	SPG4	Q04438	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ARR3	Q06598	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	POS5	Q06892	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	LAS17	Q12446	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YBL059W	P34224	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	BDH1	P39714	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	CAF16	P43569	289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	FIP1	P45976	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	VPS55	P47111	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	BOR1	P53838	576 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	ODC1	Q03028	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	COX19	Q3E731	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	SPO13	P23624	291 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YBL071C	P38185	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	DOG2	P38773	246 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	DOG1	P38774	246 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	SPC25	P40014	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	LST7	P53237	242 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRP4	YHR069C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms