RNA–Protein interactions for RNA: YER086W

ILV1, Transcript of Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis, yeast

Gene ILV1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	YER086W	SNN1	P48232	102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YGL114W	P53134	725 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YNR066C	P53752	436 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	HCH1	P53834	153 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YDL009C	Q12210	107 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YPS3	Q12303	508 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	AGC1	Q12482	902 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	COX19	Q3E731	98 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	BPH1	P25356	2167 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	LDS1	P31379	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	ECM25	P32525	599 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	ALG14	P38242	237 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YBR292C	P38357	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YHL044W	P38727	235 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YIL012W	P40551	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YIR020C	P40575	100 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ILV1	YER086W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	PEX7	P39108	375 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	COX18	P53239	316 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	STD1	Q02794	444 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	MIX17	Q03667	156 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RRG8	Q06109	277 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	DCS1	Q06151	350 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	SRB6	P32570	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	UPS2	P35200	230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	PMU1	P36069	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	VHS2	P40463	436 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	DFG10	P40526	253 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YJR056C	P47115	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	TDA6	Q06466	467 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	IRC25	Q07951	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YOS1	Q3E834	85 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	VMA16	P23968	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	AHT1	P29589	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	MSK1	P32048	576 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YGR269W	P40326	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YIL024C	P40543	189 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	ABM1	P47146	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	TMA23	Q03525	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	FCY2	P17064	533 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	CNB1	P25296	175 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	ADD37	Q03233	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	FRQ1	Q06389	190 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	MCM22	P47167	239 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	USV1	Q12132	391 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YOR015W	Q12169	119 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	POM34	Q12445	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	QCR9	P22289	66 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	CRH1	P53301	507 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	OCA2	P53949	197 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	DYN2	Q02647	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	GIM5	Q04493	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	CSI2	Q08054	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	FPR2	P32472	135 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	MIA40	P36046	403 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	CAF40	P53829	373 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	ARR3	Q06598	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YBL059W	P34224	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	PRE3	P38624	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	FLO5	P38894	1075 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	POG1	P40473	351 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	BOR1	P53838	576 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YML108W	Q03759	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RXT3	Q07458	294 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	GEP3	Q08622	556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RAD28	Q12021	506 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	ATO3	Q12359	275 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	GEP5	Q12393	293 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	SPO13	P23624	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	CDC50	P25656	391 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	VMA11	P32842	164 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YIP1	P53039	248 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	YNL234W	P53857	426 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ILV1	YER086W	PCC1	Q3E833	88 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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