RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	TCA17	P32613	152 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	UMP1	P38293	148 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YBR285W	P38354	144 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YNL217W	P40152	326 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	ICE2	P40499	491 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	GRX8	Q05926	109 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	DGA1	Q08650	418 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	VPS68	Q12016	184 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	PEX11	Q12462	236 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	REP2	P03872	296 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.79	□□□□□ -2.28	not detected
APL3	YBL037W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	MRPL17	P36528	281 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	FCY21	P40039	528 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YDR274C	P87283	123 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	MAK3	Q03503	176 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	APA2	P22108	325 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	MGT1	P26188	188 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YHR180W	P38868	163 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YER134C	P40081	178 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	POG1	P40473	351 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	TIR3	P40552	269 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	FMP32	P43557	207 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	NRK1	P53915	240 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	CYT2	Q00873	224 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	NUP49	Q02199	472 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	TRM12	Q04235	462 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	ARR2	Q06597	130 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	QCR2	P07257	368 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	MDH2	P22133	377 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	ADE1	P27616	306 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YBR209W	P38311	105 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YAP3	P38749	330 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YHR022C	P38763	256 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	DSE2	P38844	325 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	AGE2	P40529	298 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YNL184C	P53876	108 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	SNO1	Q03144	224 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	DYN3	Q04949	312 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	MCP1	Q12106	302 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APL3	YBL037W	RAD51	P25454	400 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	MEI4	P29467	408 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	TFC1	P32367	649 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	PEP8	P40335	379 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	TIM13	P53299	105 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	PET191	Q02772	108 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	GIM5	Q04493	163 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SHH4	Q06236	168 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.78	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SEC17	P32602	292 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	FZF1	P32805	299 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	MTW1	P39731	289 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YEA4	P40004	342 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	BUD25	P85052	153 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	PDR18	P53756	1333 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	NRG2	P38082	220 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SVP26	P38869	228 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CNB1	P25296	175 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	OPY1	P38271	328 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CUP9	P41817	306 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	SER2	P42941	309 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	DAN1	P47178	298 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	ODC2	Q99297	307 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	ATG40	Q99325	256 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	AHC2	P25649	128 aa		0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
APL3	YBL037W	NSG1	P38837	291 aa		0.76	□□□□□ -2.29

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