RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	GPC4	O75487	556 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	MFN2	O95140	757 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPA4L	O95757	839 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT3	P12035	628 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	HAL	P42357	657 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	JADE3	Q92613	823 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	WHRN	Q9P202	907 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	MYH10	P35580	1976 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TSPAN9	O75954	239 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	GNAZ	P19086	355 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PDK4	Q16654	411 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL2	O95198	593 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PROC	P04070	461 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	AKR1B1	P15121	316 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	RASA1	P20936	1047 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAF2	Q12933	501 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPA13	P48723	471 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	RCAN1	P53805	252 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT76	Q01546	638 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	NCOA4	Q13772	614 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT35	Q92764	455 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PIAS1	O75925	651 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXN2	P32314	431 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895		H7C0C1	242 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	CYTH3	O43739	400 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	EYA4	O95677	639 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	CD58	P19256	250 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP5O	P48047	213 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PTK7	Q13308	1070 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	NRF1	Q16656	503 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	COA7	Q96BR5	231 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	WNT7A	O00755	349 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	MAFG	O15525	162 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	DLGAP3	O95886	979 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ANXA13	P27216	316 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC5A3	P53794	718 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP4	P55087	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	ALX1	Q15699	326 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPK6	Q16659	721 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-231	ENST00000639895	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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