RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 BFSP1Q12934 665 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 MYO1EQ12965 1108 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 KCNB1Q14721 858 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA18Q8TC71 538 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 BORCS6Q96GS4 357 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 KCNK12Q9HB15 430 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 SIX4Q9UIU6 781 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 CDH7Q9ULB5 785 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 YIPF1Q9Y548 306 aa11.9□□□□□ -0.5
UBXN8-209ENST00000620074 NOTCH4Q99466 2003 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PTPRJQ12913 1337 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MTMR11A4FU01 709 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HUS1O60921 280 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 VNN2O95498 520 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 RHOP08100 348 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 OR4Q2P0C623 313 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PTPN2P17706 415 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TNNI1P19237 187 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 COL9A1P20849 921 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TWF1Q12792 350 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TDGQ13569 410 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 WSCD1Q658N2 575 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 IQCEQ6IPM2 695 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 RDH13Q8NBN7 331 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 LEMD2Q8NC56 503 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 FGF13Q92913 245 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ASIC4Q96FT7 647 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DMAC2Q9NW81 257 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.89□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ANHXE9PGG2 379 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF197O14709 1029 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MICAL2O94851 1124 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 NR3C1P04150 777 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TSPY1Q01534 308 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DUSP4Q13115 394 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HTR4Q13639 388 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 NFIL3Q16649 462 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 CENPPQ6IPU0 288 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MTSS1LQ765P7 747 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DPH6Q7L8W6 267 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ITFG1Q8TB96 612 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HPDLQ96IR7 371 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 FAM84AQ96KN4 292 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM209Q96SK2 561 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 CORO1BQ9BR76 489 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ASAH2Q9NR71 780 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 RMND1Q9NWS8 449 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 GDE1Q9NZC3 331 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 L1RE1Q9UN81 338 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.88□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ALDH1A3P47895 512 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 AP3M2P53677 418 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 EPHB3P54753 998 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 EPHA5P54756 1037 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 MYL7Q01449 175 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.87□□□□□ -0.51
UBXN8-209ENST00000620074 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms