RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 WSCD1Q658N2 575 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 LILRA6Q6PI73 481 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 HLA-CQ95604 372 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 MMS19Q96T76 1030 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 IGFLR1Q9H665 355 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 L1RE1Q9UN81 338 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.72■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 KCNJ18B7U540 433 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 OR1D2P34982 312 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF165P49910 485 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 GPR17Q13304 367 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 KCNJ12Q14500 433 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 UVSSAQ2YD98 709 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 FAM81BQ96LP2 452 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-212ENST00000596309 ABLIM3O94929 683 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TSPY1Q01534 308 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CLDND1Q9NY35 253 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 BECN2A8MW95 431 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TGM5O43548 720 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CLSTN1O94985 981 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 PAPLNO95428 1278 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ATF2P15336 505 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ROR1Q01973 937 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 AAK1Q2M2I8 961 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 UNC93AQ86WB7 457 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 BCO2Q9BYV7 579 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 SNX25Q9H3E2 840 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 FANCLQ9NW38 375 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CDH9Q9ULB4 789 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 POU2F2P09086 479 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 HOXA9P31269 272 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TPM4P67936 248 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NCAPHQ15003 741 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 VWA3BQ502W6 1294 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 LIN9Q5TKA1 542 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 PPM1EQ8WY54 764 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 SEMA4DQ92854 862 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NDST4Q9H3R1 872 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TSC2P49815 1807 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 GLP2RO95838 553 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CPB1P15086 417 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF18P17022 549 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ELF1P32519 619 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ASPAP45381 313 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 ITIH3Q06033 890 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 GBP6Q6ZN66 633 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 PALB2Q86YC2 1186 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 TNIP3Q96KP6 325 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 NT5C1BQ96P26 610 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-212ENST00000596309 WDR27A2RRH5 827 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms