RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP120Q8N960 986 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB7Q9H672 318 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SNTG2Q9NY99 539 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 USP18Q9UMW8 372 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MIA3Q5JRA6 1907 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 INPPL1O15357 1258 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 RECQL4O94761 1208 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP24A1Q07973 514 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 HTR4Q13639 388 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD6Q15008 389 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-214ENST00000592483 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 TMC2Q8TDI7 906 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-214ENST00000592483 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D4O60343 1298 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRB5O75023 590 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPLNO95428 1278 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFSF9P41273 254 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 OSTNP61366 133 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 NELL1Q92832 810 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 RSAD1Q9HA92 442 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP2Q9UGN5 583 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 DERAQ9Y315 318 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 HES2Q9Y543 173 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC26A0AVF1 554 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 BFSP1Q12934 665 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 XKR4Q5GH76 650 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 PPM1JQ5JR12 505 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-214ENST00000592483 FANCLQ9NW38 375 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTN3Q9P232 1028 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-214ENST00000592483 STX10O60499 249 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 OFD1O75665 1012 aa25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF18P17022 549 aa25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 FNBP1Q96RU3 617 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 APOL6Q9BWW8 343 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF39Q9H2S5 420 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 C2CD2Q9Y426 696 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RFPL2O75678 378 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GLUD1P00367 558 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP5P24588 427 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEA9P43362 315 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 VAMP7P51809 220 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GPC5P78333 572 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PATJQ8NI35 1801 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ18B7U540 433 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-214ENST00000592483 KCNE1P15382 129 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN10P78369 228 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ12Q14500 433 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 URGCPQ8TCY9 931 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CGRRF1Q99675 332 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PIDD1Q9HB75 910 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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