RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-211ENST00000590874 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC46A2Q9BY10 475 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB7Q9H672 318 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 DSEQ9UL01 958 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD2Q9Y426 696 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCAO75347 108 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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