RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584550.1

GGA3-219, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-219	ENST00000584550	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TAF4	O00268	1085 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RNF40	O75150	1001 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SOAT2	O75908	522 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	AKAP3	O75969	853 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	VNN2	O95498	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	EPHB3	P54753	998 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NUP205	Q92621	2012 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	STX6	O43752	255 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GABRR2	P28476	465 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	IRX4	P78413	519 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CYP4F8	P98187	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	REST	Q13127	1097 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	APPL2	Q8NEU8	664 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MED24	O75448	989 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GRM5	P41594	1212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NAMPT	P43490	491 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GALK1	P51570	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DGKE	P52429	567 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PSMD2	Q13200	908 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PLD1	Q13393	1074 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PTPA	Q15257	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CDT1	Q9H211	546 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550		K7ERI5	159 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	LAD1	O00515	517 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	APBB3	O95704	486 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ARSA	P15289	507 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CYP11B2	P19099	503 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CDC25A	P30304	524 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MAPK8	P45983	427 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SPAG1	Q07617	926 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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