RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PWWP2AQ96N64 755 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TDP1Q9NUW8 608 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 POLHQ9Y253 713 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 USP16Q9Y5T5 823 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TJP1Q07157 1748 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PPC1 479 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DAPK3O43293 454 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 RAD17O75943 681 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LY86O95711 162 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PI3P19957 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ECHS1P30084 290 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 STAT5BP51692 787 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PER3P56645 1201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GPSM2P81274 684 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DSC2Q02487 901 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 OLFM4Q6UX06 510 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 RSPH3Q86UC2 560 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 AJUBAQ96IF1 538 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 UIMC1Q96RL1 719 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 APOL5Q9BWW9 433 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KATNBL1Q9H079 304 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DMTF1Q9Y222 760 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 VWA7Q9Y334 891 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SLX4Q8IY92 1834 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SGTAO43765 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GAAP10253 952 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINB3P29508 390 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KCNQ1P51787 676 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GRAPQ13588 217 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZUG5 572 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C3orf20Q8ND61 904 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PGBD4Q96DM1 585 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC138Q96M89 665 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TBCBQ99426 244 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ARMT1Q9H993 441 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CD320Q9NPF0 282 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD3Q9Y597 815 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LTBP1Q14766 1721 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SNED1Q8TER0 1413 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 H3BUI4 141 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FFAR3O14843 346 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ARIH2O95376 493 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HMGCRP04035 888 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SETSIPP0DME0 302 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PRMT2P55345 433 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CDC42EP1Q00587 391 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FGL2Q14314 439 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SEPT2Q15019 361 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 UBE3CQ15386 1083 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC14AQ86T13 490 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SNX33Q8WV41 574 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CDCA5Q96FF9 252 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FAM167AQ96KS9 214 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA25Q9BR10 227 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.48□□□□□ -1.37
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