RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.877e-9■■■■■ 35.7
CTU2-204ENST00000564105 MYO7AQ13402 2215 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 KRT5P13647 590 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 GSDMDP57764 484 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 INCA1Q0VD86 236 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TMEM270Q6UE05 265 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TTC39CQ8N584 583 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TMEM169Q96HH4 297 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 SPG21Q9NZD8 308 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 LINC01553A4QN01 128 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 GFPT2O94808 682 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 CYP11A1P05108 521 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 FAM163BP0C2L3 166 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 PPM1AP35813 382 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 ARID5BQ14865 1188 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC7Q99615 494 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 SNX25Q9H3E2 840 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 DSEQ9UL01 958 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU2-204ENST00000564105 VCANP13611 3396 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 SYN3O14994 580 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CILPO75339 1184 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 TYMPP19971 482 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 NDST1P52848 882 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ARID5AQ03989 594 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ZNF394Q53GI3 561 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 OSTM1Q86WC4 334 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 METTL23Q86XA0 190 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CYP26A1O43174 497 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CA3P07451 260 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 FERP16591 822 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CLCN1P35523 988 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ASIC2Q16515 512 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CEP57Q86XR8 500 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 SPATA18Q8TC71 538 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 WHAMMQ8TF30 809 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 A8MXQ7 604 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 GABRDO14764 452 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 EFEMP2O95967 443 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CCDC172P0C7W6 258 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CTNNB1P35222 781 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 BMPR1AP36894 532 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 PBX2P40425 430 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 LHX1P48742 406 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 UNC93AQ86WB7 457 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 PANX2Q96RD6 677 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 TWNKQ96RR1 684 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 PBX4Q9BYU1 374 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 NME7Q9Y5B8 376 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF15O94989 841 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 FGFR3P22607 806 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 LMO2P25791 158 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTU2-204ENST00000564105 ZNF132P52740 706 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms