RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RASA4B	C9J798	803 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RASA4	O43374	803 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TOM1L1	O75674	476 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GJB6	O95452	261 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CAPS	Q13938	189 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MPP2	Q14168	576 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KAZN	Q674X7	775 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CD248	Q9HCU0	757 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SENP1	Q9P0U3	644 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ARSE	P51690	589 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SLC18A1	P54219	525 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MCEE	Q96PE7	176 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TCHP	Q9BT92	498 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		19.45	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ITGAV	P06756	1048 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KRT10	P13645	584 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RIPK1	Q13546	671 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GALNTL6	Q49A17	601 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RPAIN	Q86UA6	219 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GDAP1	Q8TB36	358 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MAML1	Q92585	1016 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		19.44	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CETP	P11597	493 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	STAT5B	P51692	787 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GPS1	Q13098	491 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NEDD9	Q14511	834 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FAM167A	Q96KS9	214 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CISH	Q9NSE2	258 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	UBOX5	O94941	541 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GH1	P01241	217 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	EDN1	P05305	212 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TRPC3	Q13507	836 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TMED2	Q15363	201 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MTFR1	Q15390	333 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PCGF5	Q86SE9	256 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ERICH1	Q86X53	443 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		19.43	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUA9	196 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559		F8VP50	259 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	OGT	O15294	1046 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FAM189A1	O60320	539 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MSC	O60682	206 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RASA2	Q15283	850 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	WLS	Q5T9L3	541 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	IER5	Q5VY09	327 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CENPU	Q71F23	418 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TRABD2A	Q86V40	505 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TCP11	Q8WWU5	503 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		19.42	■□□□□ 0.7

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