RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	AKR1B10	O60218	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GOSR1	O95249	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GNAT1	P11488	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ATF2	P15336	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ATP5D	P30049	168 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	LIMK1	P53667	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	VAMP2	P63027	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	EFR3A	Q14156	821 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	USP51	Q70EK9	711 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GGN	Q86UU5	652 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	MUL1	Q969V5	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	EYA3	Q99504	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	NPHS1	O60500	1241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	PTP4A3	O75365	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TMEM63A	O94886	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	COL6A2	P12110	1019 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ENPP1	P22413	925 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CHM	P24386	653 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TMED1	Q13445	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CEP68	Q76N32	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	DLG3	Q92796	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	POGK	Q9P215	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	FYB1	O15117	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	NOBOX	O60393	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CYP17A1	P05093	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SCG2	P13521	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	FLT1	P17948	1338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	FPR2	P25090	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CD40	P25942	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	RCAN1	P53805	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	PPARD	Q03181	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ADAM15	Q13444	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TNIP1	Q15025	636 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SEC23A	Q15436	765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	CPZ	Q66K79	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP44-208	ENST00000552440	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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