RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522062.1

CNOT7-209, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 2

Gene CNOT7, Length 444 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-209	ENST00000522062	TGM1	P22735	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	CASR	P41180	1078 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	WAS	P42768	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TM4SF4	P48230	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	NEK2	P51955	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TBX4	P57082	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ACAP2	Q15057	778 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TJP1	Q07157	1748 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	COL15A1	P39059	1388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	CENPF	P49454	3210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	AKR1B10	O60218	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	PHF2	O75151	1096 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	STC2	O76061	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	C6	P13671	934 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	GYPE	P15421	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	NPEPPS	P55786	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	DUSP2	Q05923	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	CXCL9	Q07325	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MCL1	Q07820	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MGAT2	Q10469	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	BIRC2	Q13490	618 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	SEPT2	Q15019	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT7-209	ENST00000522062	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	HTT	P42858	3142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	WNT10B	O00744	389 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	NRP1	O14786	923 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	NPHP1	O15259	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	ITGA10	O75578	1167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	GAST	P01350	101 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	NPR1	P16066	1061 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CCND1	P24385	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	EDNRB	P24530	442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CRHR1	P34998	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	SLC6A9	P48067	706 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	RHBDL3	P58872	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	DPF2	Q92785	391 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	EDA	Q92838	391 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	COG3	Q96JB2	828 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT7-209	ENST00000522062	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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