RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	LENG9	Q96B70	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH19	Q9H159	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRP1	O14786	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHF2	O75151	1096 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	INSR	P06213	1382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GNAT2	P19087	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHRNA5	P30532	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	WAS	P42768	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RABGGTB	P53611	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMF1	P82094	1093 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MNT	Q99583	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	AKR1B10	O60218	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RECQL4	O94761	1208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT4	P19013	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MGAT2	Q10469	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CST9	Q5W186	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q6ZVL8	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	COA7	Q96BR5	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	BRCA2	P51587	3418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RFPL1	O75677	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GAST	P01350	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PF4V1	P10720	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	EDNRB	P24530	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC16A1	P53985	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEPT2	Q15019	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTPA	Q15257	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q6ZPA2	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MIER2	Q8N344	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms