RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 BICD1Q96G01 975 aa17.22■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC46A2Q9BY10 475 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-215ENST00000510074 ZMYM5Q9UJ78 669 aa17.22■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC26A0AVF1 554 aa17.21■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.21■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.21■□□□□ 0.35
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SH3BP2-215ENST00000510074 RNF40O75150 1001 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP2-215ENST00000510074 C1QTNF9P0C862 333 aa17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-215ENST00000510074 TCEAL6Q6IPX3 200 aa17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-215ENST00000510074 EDEM2Q9BV94 578 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP2-215ENST00000510074 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-215ENST00000510074 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-215ENST00000510074 KARSQ15046 597 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
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