RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 P3H4Q92791 437 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MCEEQ96PE7 176 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 EPAS1Q99814 870 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SYT15Q9BQS2 421 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 SETSIPP0DME0 302 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SULT1E1P49888 294 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PPP2R5DQ14738 602 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 A0A087X0T9 212 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 CREB3O43889 395 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 DR1Q01658 176 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 GUCY2FP51841 1108 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.72□□□□□ -1.01
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