RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.67□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 MYMKA6NI61 221 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ARNTLO00327 626 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ZNF263O14978 683 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ADSSP30520 456 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ALDH1A3P47895 512 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 SOX9P48436 509 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 MYBPC2Q14324 1141 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 LEMD2Q8NC56 503 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 FAM3CQ92520 227 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 RUBCNQ92622 972 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 IRF7Q92985 503 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 USP28Q96RU2 1077 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 NELL2Q99435 816 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 DPP3Q9NY33 737 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 STYXL1Q9Y6J8 313 aa13.66□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 DNAH14Q0VDD8 3507 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 A0A087X0B3 334 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 CYB561D2O14569 222 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 NCAM2O15394 837 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R37O75864 691 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 CYP11A1P05108 521 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ATF6P18850 670 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 CCNE1P24864 410 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 GABRR2P28476 465 aa13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-212ENST00000485532 KRT85P78386 507 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 CYP4F8P98187 520 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PLD1Q13393 1074 aa13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-212ENST00000485532 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 CD302Q8IX05 232 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 STKLD1Q8NE28 680 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 GIPC2Q8TF65 315 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PSMG2Q969U7 264 aa13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 STRA6Q9BX79 667 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PANK2Q9BZ23 570 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 ASB7Q9H672 318 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 DERAQ9Y315 318 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-212ENST00000485532 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MAN2B1O00754 1011 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF12O95522 483 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SCP2P22307 547 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HOXC13P31276 330 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TAF6P49848 677 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GAS6Q14393 721 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GPR158Q5T848 1215 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 YAF2Q8IY57 180 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 NELL1Q92832 810 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SAAL1Q96ER3 474 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 BORCS6Q96GS4 357 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GBP4Q96PP9 640 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CHRDQ9H2X0 955 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 STK17AQ9UEE5 414 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 C2CD2Q9Y426 696 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
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