RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 PES1O00541 588 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 SPTLC1O15269 473 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 CCL16O15467 120 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 ZMYND10O75800 440 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 EFEMP2O95967 443 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 CYP11A1P05108 521 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 PDGFRBP09619 1106 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 WEE2P0C1S8 567 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 TRIM49P0CI25 452 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 TRIM49CP0CI26 452 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 BMP1P13497 986 aa10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 ATF2P15336 505 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 COL19A1Q14993 1142 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 VEPH1Q14D04 833 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 KRT39Q6A163 491 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 SV2AQ7L0J3 742 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 FRMD5Q7Z6J6 570 aa10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 SPATA18Q8TC71 538 aa10.26□□□□□ -0.77
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PKP4-208ENST00000462335 PTPRJQ12913 1337 aa10.25□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 SCN1AP35498 2009 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 COL6A3P12111 3177 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 WDR27A2RRH5 827 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 ZNF197O14709 1029 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 ABLIM3O94929 683 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-208ENST00000462335 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
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