RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KCNH6Q9H252 994 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KRT19P08727 400 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SRFP11831 508 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 RBP5P82980 135 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 IER5LQ5T953 404 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 IQCEQ6IPM2 695 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 RDH13Q8NBN7 331 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 GDE1Q9NZC3 331 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 L1RE1Q9UN81 338 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PRR29P0C7W0 189 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G5P39877 138 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 EPHA5P54756 1037 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CYP24A1Q07973 514 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 BFSP1Q12934 665 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD2Q13200 908 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 MTSS1LQ765P7 747 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 WDR49Q8IV35 697 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL21Q9UKT6 434 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CFHP08603 1231 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 AVPR2P30518 371 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PLD1Q13393 1074 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF197O14709 1029 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 MICAL2O94851 1124 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 TNNC2P02585 160 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CDR1P51861 262 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD6Q15008 389 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SIX5Q8N196 739 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 FAM122AQ96E09 287 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 ASAH2Q9NR71 780 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 WNT16Q9UBV4 365 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 HUS1O60921 280 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 MOSPD3O75425 235 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SOAT2O75908 522 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 EPHB3P54753 998 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 NUCB2P80303 420 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 LEMD2Q8NC56 503 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KXD1Q9BQD3 176 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 NPR3P17342 541 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 ALDH1A3P47895 512 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 DPYDQ12882 1025 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 GPR152Q8TDT2 470 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 CGRRF1Q99675 332 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC3Q9BY71 257 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB3-202ENST00000460160 KRBA1A5PL33 1030 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 EXOC3O60645 756 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF202O95125 648 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 MYL4P12829 197 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 MYO1EQ12965 1108 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TMC8Q8IU68 726 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM105Q8N8V8 129 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS33Q8NF86 280 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 HPDLQ96IR7 371 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 FNBP1Q96RU3 617 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TNNI1P19237 187 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 GPC5P78333 572 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 SMARCB1Q12824 385 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 OSTM1Q86WC4 334 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 DMAC2Q9NW81 257 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB3-202ENST00000460160 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms