RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MYBPC2Q14324 1141 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 HHIPQ96QV1 700 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 E9PMD0 336 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.632e-7■■■■□ 23.1
PTPRA-208ENST00000455631 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MAPK7Q13164 816 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 VEPH1Q14D04 833 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 PLK5Q496M5 336 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TTC38Q5R3I4 469 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TSC2P49815 1807 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 RNF40O75150 1001 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 WEE1P30291 646 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CDC25CP30307 473 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 FOXC1Q12948 553 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 GKN1Q9NS71 199 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 DNM3Q9UQ16 869 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 SFI1A8K8P3 1242 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 GIPC1O14908 333 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN3O15551 220 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TYMPP19971 482 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 GUCY2FP51841 1108 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CREB5Q02930 508 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 RUNX3Q13761 415 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ELF2Q15723 593 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 EBF3Q9H4W6 596 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 HPS4Q9NQG7 708 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MYH11P35749 1972 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 EGFP01133 1207 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ODC1P11926 461 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CYP3A5P20815 502 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CDR1P51861 262 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 MCL1Q07820 350 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TAF12Q16514 161 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 IL21Q9HBE4 155 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ANK1P16157 1881 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TTC26A0AVF1 554 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 C4orf47A7E2U8 309 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CLTAP09496 248 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ATF6P18850 670 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ZPBP2Q6X784 338 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 CHFRQ96EP1 664 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 STK24Q9Y6E0 443 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PTPRA-208ENST00000455631 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 PPEF2O14830 753 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 DCLK1O15075 740 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RHOBTB1O94844 696 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 CAVIN2O95810 425 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SPINK2P20155 84 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TNFSF9P41273 254 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 NBR1Q14596 966 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ZBTB6Q15916 424 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RAB34Q9BZG1 259 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ATRXP46100 2492 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 PP2D1A8MPX8 630 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 AVPR1AP37288 418 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 AMPD2Q01433 879 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 BFSP1Q12934 665 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 GIPC2Q8TF65 315 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 BICD1Q96G01 975 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 C8orf76Q96K31 380 aa25.19■■□□□ 1.62
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