RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PODXLO00592 558 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 DDHD2O94830 711 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ITGB1P05556 798 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 PDGFRBP09619 1106 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LMO2P25791 158 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LRPAP1P30533 357 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC142Q17RM4 750 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.161e-11■■■■■ 35.9
SH3BP2-204ENST00000452765 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 L1RE1Q9UN81 338 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT86O43790 486 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TAF6P49848 677 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 PJA2O43164 708 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPROQ16827 1216 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 NAA35Q5VZE5 725 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LAMA3Q16787 3333 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 UPP2O95045 317 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 H2AFZP0C0S5 128 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 P4HA1P13674 534 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 UPP1Q16831 310 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 H2AFVQ71UI9 128 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ACOT1Q86TX2 421 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF5CO60282 957 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 EOMESO95936 686 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CXCL10P02778 98 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SKIP12755 728 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CSF2RAP15509 400 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 BPIFB4P59827 614 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ENC1O14682 589 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 BRCC3P46736 316 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 DMTNQ08495 405 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 B3GAT3O94766 335 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ACRP10323 421 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ANXA13P27216 316 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 INCA1Q0VD86 236 aa22.26■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.26■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CYB561D2O14569 222 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.26■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.26■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 RTN2O75298 545 aa22.25■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 SV2CQ496J9 727 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.25■■□□□ 1.15
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SH3BP2-204ENST00000452765 A8MXQ7 604 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PNPLA4P41247 253 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 UBA3Q8TBC4 463 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ALPK3Q96L96 1907 aa22.23■■□□□ 1.15
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