RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448136.5

SNHG16-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG16, Length 3,607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-201ENST00000448136 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.61□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ZBTB5O15062 677 aa10.61□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 CCDC22O60826 627 aa10.61□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PANX3Q96QZ0 392 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.6□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ABCA3Q99758 1704 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.6□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ITIH2P19823 946 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 AQP4P55087 323 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ARL4CP56559 192 aa10.6□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 PTK6Q13882 451 aa10.6□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ECSITQ9BQ95 431 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 E7ENQ6 273 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 F5H6K3 240 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 COQ9O75208 318 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TFPTP0C1Z6 253 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 KLRC2P26717 231 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 JAG1P78504 1218 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 SLC25A3Q00325 362 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 IYDQ6PHW0 289 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 GCNAQ96QF7 691 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 VCX3BQ9H321 246 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 VCX3AQ9NNX9 186 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 STK32BQ9NY57 414 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 APPL1Q9UKG1 709 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.6□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.6□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 FCHO1O14526 889 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 OATP04181 439 aa10.59□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ITGA2BP08514 1039 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PEX2P28328 305 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PCSK6P29122 969 aa10.59□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 DSG1Q02413 1049 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 GABPAQ06546 454 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TFDP1Q14186 410 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 FYB2Q5VWT5 728 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.59□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.59□□□□□ -0.71
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