RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 COL4A6Q14031 1691 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 KIF16BQ96L93 1317 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 MAN2B1O00754 1011 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 NCK2O43639 380 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A27O95847 323 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 GPR19Q15760 415 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 TEX11Q8IYF3 940 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 RAB33AQ14088 237 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 RUNDC1Q96C34 613 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 CBLCQ9ULV8 474 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 NR2E1Q9Y466 385 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 LCHNA4D1U4 455 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 MBTPS2O43462 519 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 GH2P01242 217 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DOAP06340 250 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 PDE6AP16499 860 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 ADCY8P40145 1251 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 RHBDL3P58872 404 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 SPATC1Q76KD6 591 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 OSTM1Q86WC4 334 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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PTPRK-211ENST00000429595 IL17DQ8TAD2 202 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 SCYL1Q96KG9 808 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 RAD9AQ99638 391 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 CABP5Q9NP86 173 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-211ENST00000429595 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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